Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGNQ9P2M7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNQ9P2M7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms