Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHD7Q9P2D1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHD7Q9P2D1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms