Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CXXC1Q9P0U4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms