Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PKD2L1Q9P0L9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms