Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LRP1BQ9NZR2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LRP1BQ9NZR2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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