Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP1Q9NZI2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms