Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C9orf78Q9NZ63 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C9orf78Q9NZ63 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms