Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RDH8Q9NYR8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RDH8Q9NYR8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms