Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMPD3Q9NY59 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms