Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL28Q9NXS3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL28Q9NXS3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms