Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PGPEP1Q9NXJ5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PGPEP1Q9NXJ5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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