Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD8Q9NX08 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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