Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM140Q9NV12 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM140Q9NV12 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms