Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMBRD1Q9NUN5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMBRD1Q9NUN5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms