Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A9Q9NUM3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms