Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ1

C8orf17, Protein MOST-1, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf17Q9NRJ1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C8orf17Q9NRJ1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms