Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
DUOX2Q9NRD8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DUOX2Q9NRD8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms