Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ARHGEF4Q9NR80 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARHGEF4Q9NR80 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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