Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNGB3Q9NQW8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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