Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
INCENPQ9NQS7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms