Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRHQ9HD43 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRHQ9HD43 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
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