Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms