Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRABDQ9H4I3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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