Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NXF3Q9H4D5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXF3Q9H4D5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms