Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PARLQ9H300 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PARLQ9H300 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms