Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J7

SLC6A15, Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT2, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A15Q9H2J7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC6A15Q9H2J7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A15Q9H2J7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms