Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NIF3L1Q9GZT8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NIF3L1Q9GZT8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms