Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POLR1EQ9GZS1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1EQ9GZS1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1EQ9GZS1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1EQ9GZS1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1EQ9GZS1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1EQ9GZS1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1EQ9GZS1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1EQ9GZS1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1EQ9GZS1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POLR1EQ9GZS1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms