Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCSER1Q9C0I3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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