Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H5

ARHGAP39, Rho GTPase-activating protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP39Q9C0H5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARHGAP39Q9C0H5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARHGAP39Q9C0H5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms