Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM6Q9C030 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms