Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM54Q9BYV2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM54Q9BYV2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM54Q9BYV2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM54Q9BYV2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM54Q9BYV2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM54Q9BYV2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM54Q9BYV2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM54Q9BYV2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM54Q9BYV2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM54Q9BYV2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM54Q9BYV2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms