Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRAIPQ9BWF2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAIPQ9BWF2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms