Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKNK1Q9BUB5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms