Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CRACR2AQ9BSW2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRACR2AQ9BSW2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms