Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM29Q9BSF4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM29Q9BSF4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms