Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BPIFA3Q9BQP9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms