Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VGLL1Q99990 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms