Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R9BQ96SB3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R9BQ96SB3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms