Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS6KC1Q96S38 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS6KC1Q96S38 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms