Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRAMP1Q96RY5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CRAMP1Q96RY5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms