Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ALS2CR12Q96Q35 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALS2CR12Q96Q35 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms