Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP53Q96M91 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP53Q96M91 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms