Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC17Q96LX7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC17Q96LX7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms