Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2E2Q96LR5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2E2Q96LR5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms