Protein–RNA interactions for Protein: Q96LI5

CNOT6L, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6LQ96LI5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT6LQ96LI5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT6LQ96LI5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms