Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms