Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG4CQ96DT6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms