Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC47Q96A33 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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