Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSR2Q969E8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR2Q969E8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR2Q969E8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms